現(xiàn)任中科大化學(xué)物理系執(zhí)行主任、曾經(jīng)擔(dān)任朱清時秘書的閆立峰的說法更加直接：科大曾經(jīng)有一段時間，很多老師都這樣認(rèn)為的，南科大就是（中）科大的小弟弟。

2.中科大10年，可稱完滿？

在此之前，朱清時已因中國高教批判者的形象而獲得盛譽。因為在任期間堅持逆勢不擴(kuò)招，不圈地，原生態(tài)迎接教學(xué)評估，媒體和民眾贊譽其為中國最牛大學(xué)校長。中科大10年，似乎可稱完滿。

這只是事實的一面。

事實的另一面是，在中科大上任不久，朱清時開始推行去行政化改革，從后勤部門開始，所有服務(wù)系統(tǒng)逐漸取消行政級別。鐵板一塊的利益集團(tuán)被觸動了。一位1990年代起就在科大負(fù)責(zé)物業(yè)后勤的工作人員對《人物》記者回憶，雖然行政級別取消了，但是有員工活動個人關(guān)系，在后勤設(shè)立了總支，后勤設(shè)一個總支的話，那其他院系的總支就相當(dāng)于處級單位了吧，那我這個總支書記也應(yīng)該是個處級單位，處級處長。這么搞的。因為他（們）也是被逼無奈，他（們）也有很現(xiàn)實的東西。像分房子，你在科大里面，處級干部就拿處級干部的房子，那你沒有級別怎么辦嘞？

這位工作人員攤開雙手，表示無奈，朱校長呼吁是對的，每個人都知道是對的。但是在中國這個是不配套的……你在小環(huán)境里面，要脫離一個大環(huán)境，那是不可能的。

在中科大老師們的描述里，朱清時是一個果斷并且“有些清高”的領(lǐng)導(dǎo)者。前者的意思是他做決定很干脆，不瞻前顧后，也很少四處征求他人的意見。另一方面，“清高”則指向朱清時在溝通上的短板。

1990年代末，朱清時堅決抵制轟轟烈烈的大學(xué)擴(kuò)招浪潮，在中科大堅持延續(xù)小而精的辦學(xué)思路。他本人因此廣受贊譽。然而，至今還在中科大內(nèi)部有所爭議的是，朱清時當(dāng)年因此拒絕了合肥市政府主動提供給學(xué)校的廉價地皮。中科大的論壇上至今留存著一張以《朱清時校長的戰(zhàn)略錯誤》為題目的熱帖，很多人認(rèn)為他沒有適時地為學(xué)校爭取資源，不善于處理與地方政府的關(guān)系。一位中科大老師對記者說，以前那個地多便宜啊，不要錢的?，F(xiàn)在要買同樣面積的一塊地，那貴死了。

在朱清時任職后期，黨政關(guān)系有些許微妙。有中科大的老師回憶，有一段時間學(xué)校里小道消息滿天飛，比如校長的某項決定又因為一票之差沒有通過，再比如，校長在黨委常委會上拍了桌子，發(fā)火讓某位副校長辭職 雖然事實上他并沒有人事任免權(quán)。

在楊金龍看來，這更多是人的問題。他對《人物》記者說，雖然黨委和校長的矛盾天然存在，但是“一個黨委書記，一個校長，個人關(guān)系挺好，他們可以用協(xié)商的方法就把它做起來，對吧。如果兩個人的性格不一樣，做事情沒法交流的情況下……有時候并不是說這個體制怎么怎么的問題，當(dāng)時實際上它是有溝通的渠道，但是如果人和人之間做不到這一點，那可就麻煩了”。